1. Носок установлен по метке носка ботинка на лыже. Т.е. переставлять нужно обязательно пятку?
Обычно центр ботинка на лыже помечен, а если положение носка бот., то их много в зависимости от размера бот.. , если только одна риска, то это очень старые лыжи и я бы воспользовался правилом: центр ботинка находится на расстоянии от пятки лыжи L= 0.423*длину лыжи - 0.5 см
2. Какого диаметра сверлить отверстия под шурупы?
4.1 mm (4.0 то же годится)
3. Нужен-ли какой-нибудь заполнитель при их закручивании?
Желателен специальный клей, но можно и мылом, жирным кремом, ПВА
4. Чем заполнить пустые дырки?
Специальными пластиковыми затычками (в сервисах можно найти) на клее (ПВА годится).
Если нет, то спичками или деревянными пробками на водостойком клее.
5. И есть ли еще какие-нибудь подводные камни?
Целая куча: тщательно отцентруй дырки, иначе криво встанет, лыжи насквозь не просверли